Le méchant oncle de Thor, Loki, s'est échappé d'Asgard pour rechercher Yggdrasil - L'Arbre des Neuf Royaumes. L'arbre, caché sur Terre, détient le pouvoir de l'Univers. Avec l'aide du dieu des loups Fenrir, Loki prévoit de détruire l'arbre et de le replanter à son image, lui donnant un pouvoir total. Maintenant, Thor doit suivre Loki sur Terre pour mener une bataille épique afin de maintenir l'équilibre des deux mondes.